Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pus3Q9JI38 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms