Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ0

Tmod3, Tropomodulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod3Q9JHJ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmod3Q9JHJ0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms