Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cldn12Q9ET43 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Cldn12Q9ET43 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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