Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ush1cQ9ES64 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms