Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufa13Q9ERS2 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ndufa13Q9ERS2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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