Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc28a3Q9ERH8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms