Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubb3Q9ERD7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubb3Q9ERD7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms