Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stx12Q9ER00 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stx12Q9ER00 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms