Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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Vmn1r47Q9EQ51 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Vmn1r47Q9EQ51 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms