Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms