Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Tlr1Q9EPQ1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tlr1Q9EPQ1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms