Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hmgn3Q9DCB1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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