Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cpne8Q9DC53 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne8Q9DC53 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms