Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syde1Q9DBZ9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms