Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tm9sf1Q9DBU0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms