Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc97Q9DBT3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms