Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cab39lQ9DB16 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cab39lQ9DB16 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms