Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9DA42 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DA42 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DA42 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9DA42 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9DA42 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9DA42 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9DA42 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms