Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smco2Q9DA21 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smco2Q9DA21 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms