Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sgf29Q9DA08 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms