Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Subh2bvQ9D9Z7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Subh2bvQ9D9Z7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms