Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

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Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Calr3Q9D9Q6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Calr3Q9D9Q6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Calr3Q9D9Q6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Calr3Q9D9Q6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Calr3Q9D9Q6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Calr3Q9D9Q6 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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