Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms