Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bpifa3Q9D9J8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bpifa3Q9D9J8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms