Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gtf3c6Q9D8P7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf3c6Q9D8P7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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