Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Slx4ipQ9D7Y9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slx4ipQ9D7Y9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms