Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp4cQ9D7F7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chmp4cQ9D7F7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms