Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Srp19Q9D7A6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Srp19Q9D7A6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Srp19Q9D7A6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Srp19Q9D7A6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
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