Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc94Q9D6J3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc94Q9D6J3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms