Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Zcchc13Q9D548 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms