Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Gm3404Q9D506 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm3404Q9D506 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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