Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc83Q9D4V3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc83Q9D4V3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms