Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
4930564D02RikQ9D4S4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930564D02RikQ9D4S4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms