Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Phf6Q9D4J7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms