Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sohlh2Q9D489 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Sohlh2Q9D489 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms