Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Snx29Q9D3S3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms