Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R6

Katnal2, Katanin p60 ATPase-containing subunit A-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnal2Q9D3R6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Katnal2Q9D3R6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms