Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q9D2Q3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9D2Q3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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