Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vsig1Q9D2J4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms