Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fndc8Q9D2H8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Fndc8Q9D2H8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms