Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rpl34Q9D1R9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl34Q9D1R9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms