Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Stx17Q9D0I4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Stx17Q9D0I4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms