Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZS3

Fopnl, LisH domain-containing protein FOPNL, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FopnlQ9CZS3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FopnlQ9CZS3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FopnlQ9CZS3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FopnlQ9CZS3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FopnlQ9CZS3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms