Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Utp11Q9CZJ1 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Utp11Q9CZJ1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms