Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nde1Q9CZA6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms