Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zcchc8Q9CYA6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms