Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gins3Q9CY94 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gins3Q9CY94 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms