Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mis12Q9CY25 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms