Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ndufs4Q9CXZ1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms