Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cnih4Q9CX13 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms